Dans le cadre de l’enquête sur des transferts présumés frauduleux de l’OM, Pape Diouf a annoncé sa mise en examen au micro de RMC Sport : « C'est pour moi un devoir de l'annoncer et de ne pas laisser l'amalgame s'installer. Il m'a paru nécessaire d'expliquer les raisons qui ont amené à cette décision que je juge inique. Une décision qui m'a frappé d'effroi, d'indignation et d'un profond sentiment d'injustice. » Dans cette affaire, la justice reproche à l’ancien président du club d’avoir recruté Thomas Deruda (en 2005), fils de Richard Deruda, lié au grand banditisme marseillais.
