Critiqué pour son manque de proximité avec son équipe par plusieurs anciens joueurs des Girondins Bordeaux, dont l’ancien capitaine girondin Jaroslav Plasil ou encore Florent Marange, Francis Gillot à répondu à ces reproches, comme l’a relayé RMC. « J’ai entendu tellement de choses comme quoi c’était distendu que vous pouvez dire ce que vous voulez. Moi je sais comment je fonctionne et je n’ai pas à me justifier de telle ou telle chose. J’ai le même comportement. Ce sont mes adjoints qui font les entrainements, évidemment je suis un peu en dehors, je ne participe pas. Après il y a tout le travail d’entretien individuel dans mon bureau. Vous savez, on est dans un monde d’apparences. On ne capte que les apparences et tout ce qui est travail de fond on ne le voit pas. Je suis habitué, il n’y a pas de problème. »