Arrivé cet été, Juninho commence à prendre ses marques au sein de l’Olympique Lyonnais. Il effectue un retour dans son club de cœur mais dans un rôle nouveau, celui de directeur sportif. Il s’est confié sur son adaptation.
Le mauvais début de saison a eu raison de Sylvinho. Une arrivée dont Juninho, nouveau directeur sportif de l'OL, était à l'origine. Le Brésilien doit se faire à ce nouveau poste. Interrogé à ce propos lors de l’OL Night System, Juninho n’a pas fait de langue de bois : « Je savais que cela allait être difficile. Peut-être pas autant. J’ai choisi un jeune entraîneur. Cela n’a pas bien marché et j’ai perdu un peu de confiance. Je communique un peu plus avec Rudi (Garcia). J’ai la confiance de tous les joueurs. Mon rôle est de faire les liaisons. »